长非编码RNA(lncRNA)研究取得系列进展

发布者:系统管理员发布时间:2014-11-24浏览次数:2076

生物信息学实验室蒋庆华副教授在长非编码RNA(lncRNA)研究方面取得系列进展,相关研究成果于今年相继发表在《BioMed Researchinternational》(IF:2.71), 《NucleicAcids Research》(IF:8.81), 《BMCgenomics》 (IF:4.04)等期刊。

长非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200的非编码RNA转录本,主要在表观遗传、转录、转录后等层面调控基因的表达。ENCODE计划研究结果显示人类基因组中已经识别出15000多个lncRNA基因,但是,绝大部分lncRNA基因本身如何被转录调控、行使何种生物学功能以及调控哪些靶基因等问题尚未清楚。针对这些问题,蒋庆华副教授通过分析ChIP-seq数据,识别了潜在的调控~10000个lncRNA基因的转录因子,通过分析RNA-seq数据,预测了9000个lncRNA基因的功能,通过分析lncRNA敲除前后的基因芯片及RNA-seq数据、识别了lncRNA直接或间接的靶基因,并开发了相应的生物学数据库及分析平台。这些研究对于进一步认识lncRNA具有一定的意义。


论文链接:

  1. http://www.hindawi.com/journals/bmri/2014/317642/
  2. http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2014/11/15/nar.gku1173.abstract?keytype=ref&ijkey=QZ4DqpVFQjYuibo
  3. http://mlg.hit.edu.cn/lncrna2function/