从结构理解、设计生命
报告人: 张长胜博士
德州大学奥斯汀分校生物医学工程系
报告地点:生命科学与技术学院;科学园2E栋411
报告时间:2017年4月5日14:00~
报告人简历
教 育
理学博士北京大学物理化学系,定量生物学中心 2011年6月
学位论文: “蛋白质-蛋白质对接与蛋白质相互作用设计”
导师: 来鲁华教授
工学学士哈尔滨工业大学理学院化学系 2005年7月
化学工程与工艺专业,辅修计算机科学专业
科研经历
德州大学奥斯汀分校生物医学工程系博士后
2014-至今
合作导师:Ren Pengyu教授
研究方向:计算化学与计算结构生物学
研究项目:1)发展新一代的核酸(DNA/RNA)分子力场AMOEBA-DNA/RNA(NIH)
2)抗菌肽-DNA液晶结构研究(与加州纳米中心Gerand Wong教授合作)
3)JNK2四聚体结构建模,以USP18为靶标的药物设计(与Kevin Dalby教授合作,德州癌症研究中心项目)
北京大学化学院,北大-清华生命科学联合研究中心博士后 2011-2014
合作导师:来鲁华教授
研究方向:计算结构生物学(蛋白质设计及蛋白质药物设计)
研究项目:1) 计算机从头设计肿瘤坏死因子(TNFα)抑制多肽,采用两种抑制策略用Rosetta程序从头设计具有螺旋结构的多肽药物,
2) 计算机设计高结合能、高选择性的铀酰离子结合蛋白(与芝加哥大学何川教授合作)
北京大学化学院博士研究生
2005-2011
导师:来鲁华教授
研究方向:计算生物物理化学
研究项目:1) 发展蛋白-蛋白分子对接程序SDOCK, 基于蛋白-蛋白对接的虚拟筛选方法寻找新的TNFα结合蛋白
2) 基于关键残基的蛋白-蛋白相互作用及酶设计软件AutoMatch,并用这个程序设计TNFα 的抑制剂,
3) 计算机设计锌离子结合蛋白
教学/工作经历
F1000Prime:推荐计算化学,计算结构生物学领域的优秀文章 2016
北京大学结构化学课程助教 2012
北京大学普通化学实验课程助教 2008
北京大学定量分析化学实验课程助教 2007